擬似プロリンジペプチドの役割

擬似プロリンジペプチドには、セリンまたはスレオニンから形成されたオキサゾールが含まれています。トリフルオロ酢酸（TFA）で処理すると、オキサゾールはセリンまたはスレオニンに変換されます。オキサゾールはプロリンと構造的な類似性を持っているため、擬似プロリンと名付けられています。プロリンのように、擬似プロリンはペプチドのポリアミド骨格に「ねじれ」を形成します。このキンクは、凝集の原因となる視線の水素結合を混乱させます。プソイドプロリンをペプチド配列に組み込むと、結合効率が向上し、それによってペプチドの純度と収率が向上します。擬似プロリンへの結合は困難であり、カップリングの収率は通常低くなります。したがって、擬似プロリンは、ペプチド合成における事前に形成された擬似プロリンジペプチドとして使用されます。 

シュードプロリンは、弱酸性条件下で安定しています。シュードプロリンを含むペプチドは、2-クロロトリチル樹脂またはサーバー樹脂で調製し、プソードプロリンの存在下で切断できます。

対応する標準ペプチドと比較して、擬似プロリンを含むペプチドは溶解度が向上します。これにより、擬似プロリンを含むペプチドが断片的な凝縮反応で精製し、使用しやすくなります。さらに、C末端に擬似プロリンを含むペプチドは、C末端残基のラセミ化なしで結合することができます。 

線形ペプチドの擬似プロリンによって引き起こされる結び目は、環状ペプチドを形成するのに役立ちます。擬似プロリンを添加すると、環状ペプチドの収率が増加し、環化反応が加速できることが報告されています。 

擬似プロリンは、ペプチド骨格の水素結合を破壊します。 

擬似プロリンは、ペプチド鎖間の水素結合を破壊します。 

擬似プロリンは、アスパラギンの副産物とアスパラギンの形成によって生成されるアスパラギンの形成をブロックします。これは、大腸菌リボヌクレオチドレダクターゼのR2サブユニットの半合成に使用されます。この方法は最近、エリスロポエチンのグリコペプチドドメインの合成にも適用されています。 

シュードプロリンジペプチドの使用に関するガイドライン 

可能であれば、疎水性領域の前に擬似プロリンを挿入します。 

擬似プロリン残基の間に、または擬似プロリンとプロリンの間に少なくとも2つのアミノ酸があるはずです。 

最適な間隔は、擬似プロリンの間、または擬似プロリンとプロリンの間の5〜6アミノ酸です。